创建一个补充序列捕获探针文库

一个补充序列捕获探针文库（简称补充库）支持额外的序列捕获探针，这些探针在您创建一个合并序列捕获探针文库时被添加到具体的基础序列捕获探针文库中。当您创建一个补充库时，您首先需要选择一个“安捷伦目录”库作为基础库。然后eArray会使用您所提供的基因组片段，进行“序列捕获探针基因组叠瓦式设计”，来创建补充库中的序列捕获探针。对于“序列捕获探针叠瓦式设计”任务，eArray会使用与基础库中所设计探针相同的参数。补充库有一些重要的限制。请参阅本主题结尾的注释部分。

在您创建一个补充库之前

• 确定您想要使用作为基础库的“安捷伦目录”库。若要查看可用的序列捕获探针文库，您可以浏览安捷伦目录文件夹。如果基础库字样出现在序列捕获探针文库类型栏中，说明该序列捕获探针文库可用作基础库。

• (可选操作) 创建一个*.txt文件，包含您想要设计额外探针的基因组片段列表。每行放置一个片段。使用一下格式样例：chr17:12345678-12789011

创建一个补充序列捕获探针文库

使用一个向导来创建一个补充库。请按照以下步骤来启动向导：

1. 设置应用类型为SureSelect Target Enrichment。

2. 在“工作组”标签的首页中，在“序列捕获探针文库向导”下，选择通过序列捕获探针叠瓦式设计创建补充序列捕获探针文库，然后点击下一步。
   
   “通过序列捕获探针叠瓦式设计来创建补充库”向导会出现，首先出现的是第一步。向导的每个步骤如下所示。

   • 步骤 1 – 序列捕获探针文库选项和目标详细信息

   • 步骤 2 – 上传消息

   • 步骤 3 – 定义序列捕获探针文库

   • 步骤 4 – 布局序列捕获探针

   • 步骤 5 – 创建序列捕获探针文库
      

步骤 1 – 序列捕获探针文库选项和目标详细信息

在此步骤，您需要选择一个基础序列捕获探针文库，并基于该基础库中探针叠瓦式设计参数来建立一个叠瓦式设计任务。更多关于序列捕获探针叠瓦式设计的信息，请参阅序列捕获探针叠瓦式设计。

1. 在“选择基础序列捕获探针文库”下，在序列捕获探针文库名称处，选择想要的基础库。可作为基础库的“安捷伦目录”库会出现在列表中。
   
   eArray在“设计选项”中设置大多数参数，基于您选择的基础库的叠瓦式设计参数。

2. 在“设计选项”下，在设计任务名称中，输入一个用来识别此“叠瓦式设计”任务的名称。“设计选项”下的所有其他参数都是只读的，并且已被自动设置好。

3. 在目标详细信息下，输入您希望被叠瓦的基因组片段的信息，以及避免叠瓦的基因组片段信息。请参照以下详细信息：

4. 点击提交。
   
   向导的下一步会出现。
    

步骤 2 – 上传消息

在此步骤，一个消息会告知您，您的“序列捕获探针叠瓦式设计”任务已经被提交，在该任务完成后您将收到电子邮件通知。

• 阅读该消息，然后点击关闭。
  
  向导会关闭。在您继续进行操作之前，您必须等待eArray完成该“序列捕获探针叠瓦式设计”任务，该任务可能需要一天或几天。您可以在“工作区”标签主页中的“序列捕获探针文库向导”栏的底部监测该任务的状态。任务状态如下所示： 

  状态	描述
  序列捕获探针叠瓦式设计提交	该任务已经被提交至安捷伦，但还未对其进行操作。
  序列捕获探针上传进行中	该任务已经被提交至安捷伦，并已经开始处理。
  序列捕获探针已被上传	该任务已被安捷伦完成，结果已经可用。
  错误	该任务已经被提交至安捷伦，但出现问题。您必须重新提交您的任务。eArray会就该错误给您发送电子邮件，邮件中会包含错误的详细信息。

当任务的状态为“序列捕获探针已被上传”时，您就可以继续向导了。
 

步骤3 – 对于序列捕获探针文库

在此步骤中，您需要定义补充库的特定参数。在您继续向导之前，您在之前步骤中提交的序列捕获探针叠瓦式设计任务的状态必须为“序列捕获探针已被上传”。

1. 点击工作区标签，然后点击首页标签。
   
   您的工作区的首页会出现。

2. 在“序列捕获探针文库向导”框的地步，在您提交的“序列捕获探针叠瓦式设计任务”旁边的操作栏中，点击继续。
   
   向导会再次出现。

3. 在“定义序列捕获探针文库”下，输入序列捕获探针文库的参数。下表描述了会出现的参数。某些参数由系统设定，且不能被更改。

4. 点击下一步。
   
   向导的下一步将出现。
    

步骤 4 – 布局序列捕获探针

在此步骤中，您查看补充库的内容和统计数据。

1. 查看出现在此步骤中的信息。全部项目均为只读，您无法修改序列捕获探针文库的序列捕获探针内容。

2. 请进行一下操作之一：

   • 如果特征点占用百分比超过100%，或其他项目不被接受，请点击取消。此操作会结束向导。您可以重新开始向导，并输入其他叠瓦式设计参数。

   • 如要继续向导，请点击下一步。
     
     向导的下一步会出现。
      

步骤 5 – 创建序列捕获探针文库

在此步骤中，您为您新创建的补充库选择一个状态，并创建该库。

1. 选择以下选项之一：

   •  

     • 完成 – 该库的状态将被置为“完成”，并被保存到您指定的位置。此状态的序列捕获探针文库不能再被编辑。稍后，您就可以提交此库至安捷伦生产部门，并随之进行价格咨询或通过eArray来从安捷伦在线商店进行购买。

   • • 提交 – 该库的状态将被置为“提交”，并被保存到您指定的位置。此状态的序列捕获探针文库不能再被编辑或被删除。此外，eArray会将该库提交至安捷伦生产部门，并使之可被进行价格咨询或通过eArray来从安捷伦在线商店进行购买。

2. 进行以下操作之一：

   • 如果您选择了“完成”状态，请参照一下步骤：

   • 1. 点击保存、
        一个消息会告知您您的序列捕获探针文库已经被成功创建。

     2. 点击关闭。

   • 如果您选择了“提交”状态，请参照一下步骤：

   1. 1. 点击设计检查清单。
         序列捕获探针文库检查清单会出现。

      2. 阅读并选中清单中的全部项目，然后点击完成。

      3. 点击保存。
         eArray会保存此补充序列捕获探针文库到您指定的位置，并提交其至安捷伦生产部门。一个消息会告知您，您在该库被成功提交至安捷伦生产部门后会收到电子邮件通知。

      4. 点击关闭。

在任何一种情况下，eArray都会创建该序列捕获探针文库，并保存到您指定的位置。一个消息会告知您，该库已被成功创建。

3. 点击关闭。
   
   一个消息会告知您，文件写入正在进行中。

4. 点击关闭。
   
   eArray会在“查看序列捕获探针文库”页面中显示该序列捕获探针文库的详细信息。关于详细信息，请参阅查看序列捕获探针文库。

   • 注意:
     
     • 您可以基于一个基础库而创建任意个补充库。然而，在一个合并库中，您仅可以包含一个补充库。
     
     • 一个补充库与一个具体的基础库相关联。在一个合并库中，一个给定的补充库仅可以被包含在其与之关联的基础库中。
     
     • 您在对合并库进行价格咨询或者通过eArray来在安捷伦在线商店购买该库，报价（订单）通常包含基础库和所关联的补充库。然而，您也可以对补充库进行单独的价格咨询。报价和订购补充库的过程与普通的自定义序列捕获探针文库是一样的。
     • eArray补充库的状态为“完成”或“提交”。因此，补充库无法被编辑。
     
     • eArray会根据您所输入的基因组片段来创建一个序列捕获探针组，通过“序列捕获探针叠瓦式设计”过程。因为此探针组的状态为“锁定”，所以您无法编辑它。然而，您可以查找或浏览该序列捕获探针组，并进行该状态允许进行的所有操作。请参阅序列捕获探针组。
     
     • 您不能移动或共享一个补充库。
     
     • 您可以在您的个人用户工作区中创建一个补充序列捕获探针文库，但您不能在一个合作中创建。

3. 相关链接

创建一个合并库

序列捕获探针叠瓦式设计