下载CGH/ChIP探针评分结果

 

在您建立一个CGH/ChIP探针评分任务,并且eArray完成它之后,该任务的状态就为“完成”,您就可以下载结果了。

  1. 设置应用类型CGH或ChIP。

  2. 点击工作区标签,或进入一个合作

  3. 点击探针 > 探针评分。

    一个探针上传页面会出现。查找结果框会出现在页面底部,包含您当前的CGH或ChIP探针评分任务。

  4. 在“操作结果”框中找到想要检查的任务。它的状态会出现在“状态”栏中。

    eArray不会在出现时自动更新任务列表。点击刷新来更新列表至最近状态。

  5. 在“查找结果”的操作栏中,在想要下载的任务旁边,点击下载。

    一个“文件下载”窗口会出现。

  6. 点击保存。

    一个“另存为”对话框会出现。

  7. 为下载的文件选择一个位置,然后点击保存。

    eArray会下载一个*.zip格式文件到您指定的位置上。您可以解压缩该文件,并用文字处理软件或电子表格软件来进行查看。会包含以下可用文件:

文件

内容

fit.txt

列出每个提交至评分的探针,以及它的解链温度(Tm),% GC,和表现评分。

在此文件中,PredictedSlope栏给出了探针的表现评分。分数越高,说明此探针在安捷伦的微阵列平台上产生优良的对数比例反应的可能性就越大。

ProbeScoreCuration_fate

列出每个提交至评分的探针,以及它的状态、长度(以核苷酸为单位)。如果探针通过了验证检查,那么它的状态就为通过。探针未能通过验证的原因可能是:

  • 含有一个不正确或重复的探针ID号

  • 太长或太短

  • 被认定为是非相容的

  • 与eArray中另外一个已存在的探针含有一个相同的序列,因此被移除

ProbeScoreCuration_sum

给出探针评分任务的通用识别信息和所评分的探针组的统计信息。

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