什么是CGH探针评分？
安捷伦的HD-CGH探针数据库中的每一个探针都有一个表现评分，数值介于0和1之间。得分越高，就表示一个探针越有可能在一个安捷伦的CGH微阵列上产生一个良好的指数比率。由eArray产生的评分是基于一种统计模型，对应在一个模型系统中的探针指数比率，来回归计算由计算机模拟的探针参数。使用的参数包括解链温度、GC含量、一个发夹deltaG ，序列复杂性，以及衡量与参照基因组的其余部分的相似度的标准。 该探针评分是对特定探针指数比的预测。响应是指观察和预测的比率。 高密度数据库中的所有探针的平均得分 是0.759，安捷伦目录阵列探针AMADID 021529 (SurePrint G3 Human CGH Microarray 1x1 M)的平均得分是0.917。
您可以从eArray获得定制探针的分数（如通过“基因组叠瓦”设计的探针）。如要进行此操作，请提交探针评分任务（在“探针”下，“评分自定义探针”下）。在自定义评分时，上述所有数据都会进行计算并被插入到模型中来生成探针得分。一旦探针评分任务完成，CGH探针评分就可以在探针评分任务中被下载，或者通过下载探针组中的tdt文件。得分低探针可以筛选到eArray之外，通过下载特定评分的探针组并且可以设定一个评分门限，得到一组得分超过门限的探针列表。 在DNA Analytics软件（Genomic Workbench 6.0 或更高版本的组成部分）中，探针可以通过探针得分来进行筛选。
下图表示安捷伦的HD-CGH探针的探针评分和“基因组叠瓦式设计”探针的探针评分。如同预计的一样，基因组叠瓦式设计返回的探针评分十分相似。这是因为基因组叠瓦式设计在选择探针序列时不考虑探针评分。另一方面，高密度（HD）查找应用算法，在根据表现评分选择高分探针时，均匀的选择指定密度的探针。
