下载基因组叠瓦式设计结果

 

关于基因组叠瓦式设计的综述,请参阅关于基因组叠瓦式设计

在您建立了一个基因组叠瓦式设计任务,并且eArray完成了它之后,该任务会出现在“基因组叠瓦式设计”页面的“查找结果”框中,状态为“已完成”。您也会收到来自安捷伦的邮件。然后您就可以下载该结果了。

  1. 点击工作区标签。

  2. 如需要,请设置应用类型CGH, ChIP,或SureSelect Capture微阵列。

  3. 点击探针 > 基因组叠瓦式设计。

    “基因组叠瓦式设计”页面将会出现。一个查找结果框会出现在页面底部,该框列出了您当前的“基因组叠瓦式设计”任务。

  4. 在“查找结果”框的操作栏中,在您想要下载的任务旁边,点击下载。

    一个对话框会出现。

  5. 点击保存。

    一个“另存为”对话框会出现。

  6. 为下载文件选择一个位置,然后点击保存。

    eArray会以.zip格式将该“基因组叠瓦式设计”的结果下载至您计算机上指定的位置。

    下载的.zip压缩包包含三个独立的文件,分别对应于可用结果的三种类型。详细信息请看下表。所有文件都是以制表位分隔的文本文件,您可以通过一个文字处理软件或电子表格软件来查看。

文件

结果

描述

Tiling_sum

设计摘要

关于由“基因组叠瓦式设计”过程生产的探针集合的总览信息,包含探针长度和数量的统计信息。

Tiling_tdt

设计详细信息

列出探针设计过程中生成的探针,以及每个探针的具体信息,包含它的长度、序列、以及它来源的目标序列。

Tiling_fate

目标序列命运

在基因组叠瓦式设计过程中使用的目标序列的列表,包含那些生产了探针,那些没有生产这样的信息。

Tiling_bed

Bed文件

BED格式轨道文件,用于兼容的基因组浏览器。此文件包含全部生成探针的基因组坐标和名称。

注意:如要输入此文件到一个基因组浏览器,您可能需要重新将该文件命名为.bed后缀。

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