提供特征点顺序 |
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eArray的标准探针布局方法会将探针随机的分布到特征点位置上去。eArray同时也支持非随机的布局。尽管安捷伦不推荐使用非随机的“有序”布局,但它让您可以指定探针在微阵列上的位置。eArray支持CGH、ChIP、和Expression微阵列设计的有序布局,但不支持微阵列设计集。
如要创建一个非随机探针布局的微阵列,您首先需要在创建设计时在“特征点布局”处选择用户指定。在您完成了设计并将其保存为“完成”状态后,您要从eArray下载您的设计的无需探针列表。您可以按需要重新排布文件中的探针顺序,然后上传该重新排布后的文件。eArray按照行来读取并排布探针。在每行中,它从左至右布局探针。
注意:
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当您使用一个“设计向导”来创建微阵列设计时,仅可用随机特征点顺序。
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用户指定特征点布局不可用于microRNA和SureSelect Capture微阵列应用类型。
在查找结果的操作栏中,在您想要的微阵列设计旁边,点击提供特征点顺序。
“微阵列设计的探针顺序”页面将在一个新窗口中打开。如果您不再想指定设计中的特征点顺序,请选择随机,然后在出现的对话框中,点击确认。
点击下载列表来排序。
一个对话框将出现。
点击保存。
一个“另存为”对话框将出现。
为该文件选择一个位置,然后点击保存。
eArray将以.zip格式下载该探针列表。
从该.zip压缩包中解压缩探针文件,并编辑它,将探针置于您想要的顺序。您可以用一个电子表格程序来编辑解压缩后的TDT格式文件。请不要添加或删除探针。保留栏目标题完整,然后将编辑后的文件保存为*.tdt文件。
在“微阵列设计的探针顺序”页面,在“上传有序列表”处,点击浏览...
一个对话框将出现。
选择包含重新排列后的探针的TDT文件,然后点击打开。
该文件的位置将出现在“上传有序列表”处。
点击上传。
eArray将上传您的编辑过的探针列表。一个消息会出现。
点击关闭。
在您成功上传探针文件后,您可以提交该设计至“安捷伦生产部门”。在提交之后,您可以对它进行价格咨询,或者通过eArray从安捷伦在线商店进行购买。
注意:
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如果您添加了连接器,这些连接器不出现在下载的探针列表的探针序列中。但连接器会出现在最终的打印文件中,在您提交设计时,eArray将该打印文件发送至“安捷伦生产部门”。
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如果您选择更改设计中的探针组的对照类型,这并不影响探针的顺序。eArray仍会使用您上传的有序探针列表。
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有序探针列表只能上传一次。
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