计算的序列捕获探针文库统计数据

统计数据

描述

可用特征点数目

序列捕获探针文库中未使用特征点的总数。您可以使用这些未使用的特征点来承载更多的序列捕获探针，或者用它们来增加序列捕获探针文库中选定探针的重复数量。

示例：您设计一个序列捕获探针文库包含12,000个序列捕获探针，包括所要求的重复、以及安捷伦对照序列捕获探针组。当前可用的序列捕获探针文库格式(1 X 55K)可以最多承载57,750个序列捕获探针。因此，可用的特征点数目 = 57,750 - 12,000 = 45,750。

安捷伦对照探针数目

序列捕获探针文库中包含的安捷伦质量对照序列捕获探针。安捷伦使用这些序列捕获探针来在序列捕获探针文库生产过程中进行质量控制和对照。

用户对照探针数目

序列捕获探针组中，您指定为阳性或阴性对照序列捕获探针组的序列捕获探针数目。这些对照对序列捕获探针文库的构成没有影响。eArray将此信息附加到序列捕获探针组中，以供您将来参考。

填充百分比

您的序列捕获探针文库中，需要承载所要求的序列捕获探针组和安捷伦对照探针的特征点数目的百分比。

示例：您设计的序列捕获探针文库文库包含12,000个序列捕获探针，1 X 55K序列捕获探针文库中特征点的总数为57,750个序列捕获探针。填充百分比 = 12,000 / 57,750 = 20.8%

特征点总数

一个序列捕获探针文库可以承载的最大序列捕获探针数目。当前，安捷伦提供大小为1 X 55K的序列捕获探针文库，可以承载最多57,750个序列捕获探针。

碱基对覆盖率

如果序列捕获探针文库中全部探针的染色体位置都被定义了，此数据就为库中染色体中的至少被一个探针覆盖的全部碱基对数目 (以mb为单位) 。

如果库中一个或多个探针的染色体位置没有被定义，那么此数据就是一个估计值。所作出的估计是基于库中的特异性探针数、探针长度、以及叠瓦式设计的密度。除非另作说明，eArray假设序列捕获探针叠瓦的密度为2x。

特异序列捕获探针数目

 序列捕获探针文库中，不同的序列捕获探针序列。