编辑序列捕获探针文库

 

如要编辑一个序列捕获探针文库,您必须首先查找或浏览想要编辑的序列捕获探针文库。然后您就可以做出修改,并保存。

本主题描述了怎样编辑一个您拥有的序列捕获探针文库,和状态为“草稿”的序列捕获探针文库。如果您想要更改一个状态为“审查”的序列捕获探针文库,或者您想要在一个合作区中更改一个序列捕获探针文库,请参阅审查序列捕获探针文库。您不能编辑一个状态为“完成”或“已提交”的序列捕获探针文库。由于eArray创建补充库合并库的状态为“完成”或“提交”,您也无法编辑这些类型的序列捕获探针文库。

在您编辑一个序列捕获探针文库或序列捕获探针文库集之前

编辑一个序列捕获探针文库

  1. 查找浏览您想要编辑的序列捕获探针文库。

    一个序列捕获探针文库列表会出现。使用页面链接来在多个页面间翻页。

    如要筛选列表,仅显示状态为“草稿”的项目,请在查找结果上方,在状态处,选择草稿,然后点击筛选器。

  2. 操作栏中,在想要编辑的序列捕获探针文库旁边,点击编辑。仅当您是一个序列捕获探针文库的所有者时,且它的状态为“草稿”时,您才可以编辑它。如要修改状态为“审查”的序列捕获探针文库,请参阅审查序列捕获探针文库
    编辑序列捕获探针文库页面将出现。

  1. 按需要更改以下参数。除非另作说明,编辑页面出现的全部参数都是必填的。

参数

说明/详细信息

序列捕获探针文库名称

输入一个新的名称。eArray使用此名称作为序列捕获探针文库的一个查找条件,也是在查找结果、列表、以及类似地方用来指代此序列捕获探针文库的方式。

状态

选择想要的状态。序列捕获探针文库的状态与微阵列序列捕获探针文库的状态相同。更多信息请参阅微阵列序列捕获探针文库状态综述

  • 重要:一个序列捕获探针文库的的状态变化遵循一个固定的顺序。一旦您进入到下一状态,您将无法返回到前一个状态。

序列捕获探针文库容量

(只读) 序列捕获探针文库的容量将显示。当前,eArray支持容量为55k个序列捕获探针的序列捕获探针文库。如要查看更多信息,请点击显示详细信息。

文件夹

为您新的序列捕获探针文库选择一个位置。那些您拥有访问权限的文件夹将出现在列表中。

内置质控序列捕获探针组

(只读) eArray自动为序列捕获探针文库选择一个合适的内置质控序列捕获探针组。安捷伦内置质控序列捕获探针组的名称会显示为一条链接。如要查看该内置质控序列捕获探针组的详细信息,请点击该链接。

所需的安捷伦内置质控序列捕获探针组包含用于在序列捕获探针文库生产过程中进行质量控制的序列捕获探针。

附件

(选填) 附件就是与您的序列捕获探针文库相关的文件或链接。附件文件最大可以有32 MB。如要添加一个或多个附件,请参照以下步骤:

  1. 点击 plus_minus_icon.gif
    一个页面将在一个新窗口中出现。

  2. 在“添加附件”框中,指定以下信息:

名称 – 为附件输入一个名称。此名称将成为您访问附件而用来点击的链接。

类型 – 从列表中选择想要添加的附件的类型。一个附件可以使一个文件或是一个URL。

位置 – 从列表中选择恰当的位置。eArray使用此选项来选择已在您的区域中定位的内容,如果该内容可用的话。

文件 – (仅当您选择附件类型为“文件”时) 点击浏览... 在出现的对话框中选择想要添加的附件,然后点击打开。

URL – (仅当您选择附件类型为“URL”时) 输入因特网资源的位置URL,包括协议说明符。例如,http://www.agilent.com。

  1. 点击添加。
    附件将出现在窗口顶部的“附件标题列表”中。会显示一个成功消息。

  2. 点击关闭。

  3. 如需要,可添加更多附件。
    如果您添加的一个附件出错,在“附件标题列表”中选中它名称旁边的复选框,然后点击移除。

  4. 点击完成。
    窗口将关闭。您的附件的名称作为链接出现在“附件”处。.

描述

(选填) 为该序列捕获探针文库输入一个简要的描述。

关键词

(选填) 输入新的查找关键词来与该序列捕获探针文库关联,用逗号分隔。指定关键词可以帮助您稍后来查找此序列捕获探针文库。

备注

(选填) 输入一段备注来包含在序列捕获探针文库中。

上表中未出现但在页面上出现的参数,或是由eArray计算,或是只读的指示性参数,因此无法被编辑。当您进行设计决策或添加和移除序列捕获探针组时,特定的注释会出现在框的右边,作为对序列捕获探针文库数据的跟踪。关于这些值的含义请参阅计算的微阵列的统计数据

  1. 在“序列捕获探针组详细信息”标签下,对序列捕获探针文库中应用的序列捕获探针组做出修改。

任务

说明/详细信息

序列捕获探针组详细信息

添加序列捕获探针组

如要向您的序列捕获探针文库中添加一个序列捕获探针组:

  1. 点击添加。
    一个序列捕获探针组选择页面会出现。

  2. 序列捕获探针组名称处,输入一个序列捕获探针组的完整或部分名称,然后点击查找。如要返回全部可用序列捕获探针组的列表,请不要填写“序列捕获探针组名称”。.
    一个序列捕获探针组的列表将会出现。

  3. 进行以下任意操作来导航序列捕获探针组列表。

    • 如要在多个页面间翻页,请使用页面链接。

    • 如要将列表按照某个栏目的内容进行排序,请点击该栏目标题。如要将列表按逆序排列,请再次点击该栏目标题。

    • 如要仅显示某个特定文件夹中的序列捕获探针组,请在文件夹处选择想要的文件夹,然后点击筛选器。

  1. 点击想要的序列捕获探针组的名称以选中它。您可以在一个页面上选择多个序列捕获探针组。

  2. 点击添加 >。
    eArray会将选中的序列捕获探针组转移至“已选择序列捕获探针组”列表中。

  3. 进行以下任意操作来更改“已选择序列捕获探针组”列表:

    • 添加另外一个序列捕获探针组。

    • 进行另外一次的序列捕获探针组查找。您可以从多个查找中添加序列捕获探针组。

    • 添加页面上全部可见的序列捕获探针组 — 点击添加全部 >>。

    • 重新开始  — 点击 << 移除全部。

    • 移除一个序列捕获探针组 — 选择想要移除的序列捕获探针组,然后点击 < 移除。

  4. 点击完成。您可能需要下拉页面来看见此按键。
    选中的序列捕获探针组会出现在主窗口中的“序列捕获探针组详细信息”处。
    如要添加其他的序列捕获探针组,请再次点击添加。

  5. 注意:序列捕获探针文库中的所有序列捕获探针必须为同一长度。

查看一个序列捕获探针组

序列捕获探针组名称栏中,序列捕获探针组的名称显示为链接。点击恰当的链接来查看序列捕获探针组的详细信息。

“查看序列捕获探针组”页面将在一个新窗口中打开。关于此页面的详细信息,请参阅查看序列捕获探针组

移除序列捕获探针组

如要从序列捕获探针文库中移除一个序列捕获探针组:

  1. 选中您想要移除的序列捕获探针组名称旁边的复选框。

  2. 点击移除。

更改序列捕获探针组的对照类型

序列捕获探针组详细信息下,在恰当的序列捕获探针组旁边的对照类型栏中,选择一个选项。您选择的选项不影响序列捕获探针文库的组成。eArray会将此选项附加到序列捕获探针组以用作用户参考。

neg、pos、或是ignore  –  说明此序列捕获探针组包含的对照序列捕获探针是用来监测捕获质量、或者其他对照或QC应用的。

biological  – 说明此序列捕获探针组包含biological探针用来捕获想要的基因组区域。

更改序列捕获探针组的复本数量

重复栏中,在想要的序列捕获探针组旁边,输入您想要包含在序列捕获探针文库中的该序列捕获探针组的复本数量。

  • 注意:.

    eArray同时会将所需的安捷伦内置质控序列捕获探针组复制相同的数目。.

    eArray会自动尽可能多的包含完整的序列捕获探针集合,来填充进序列捕获探针文库的可用空间。例如:您的序列捕获探针文库含有12000个序列捕获探针,包括所需的安捷伦对照序列捕获探针1X 55K序列捕获探针文库的格式是57,750可承载序列捕获探针。eArray则会将四个序列捕获探针的完整集合添加进您的序列捕获探针文库 (12,000 x 4 = 48,000 序列捕获探针)。如果添加五个,则会超过序列捕获探针文库的容量 (12,000 x 5 = 60,000 序列捕获探针)。

  1. 点击保存。

    eArray会保存序列捕获探针文库到您指定的文件夹中。一个成功的消息会出现。

  2. 点击关闭。

    eArray会将您返回至“编辑序列捕获探针文库页面”,在那里您可以进行其他操作。

相关链接

审查序列捕获探针文库

序列捕获探针文库

靶向序列捕获和eArray