怎样上传探针文件至eArray

一种向eArray中引进新内容的方式就是上传一个探针文件。您可以上传探针序列和注释的数据至eArray,并使用上传的探针来创建一个新的探针组,或将上传的探针添加到一个已存在的探针组中。稍后,您可以用这些探针创建一个微阵列设计

当您上传探针至eArray,您是将数据提交至一个数据库。数据库的目的是存储并让您可以查找唯一的记录。如果您上传的文件包含重复探针,您可以选中在上传中移除重复探针选项,eArray就会移除重复项。

eArray可以全过程指导您通过上传探针创建一个微阵列设计。请参阅通过上传探针来创建设计(向导)。此外,您可以在eArray中使用快捷微阵列功能来直接上传探针至“安捷伦生产部门”

在您上传之前

上传探针文件

  1. 点击工作区标签,或进入一个合作

  2. 设置应用类型,如需要。
     

  3. 点击探针 > 上传。

    “探针上传”页面将出现。

  4. 指定以下参数。所有都为必填。

参数

说明/详细

探针参数详细信息

物种

在下拉列表中选择想要的物种。

在上传中移除重复探针

一个重复探针与文件中另外一个探针拥有相同的探针ID。如果您选中此复选框,eArray会上传您的文件中每个重复集合的第一个探针,并忽略其他。

  • 注意:如果您的探针文件包含重复探针,并且您没有选中在上传中移除重复探针,eArray会在您开始上传之后显示一个出错信息,并不会上传您的文件。

探针优先级

这些选项指定了,当eArray发现您上传文件中有探针匹配(拥有相同的探针ID和序列)系统中已存在的探针,eArray会怎样处理。选择以下选项之一:

更新已存在探针的注释 – 上传的匹配探针的注释会替换已存在探针的注释。您可以用此选项来重新注释已存在的探针。

跳过已存在探针 – eArray会忽略上传的匹配探针。

如果探针已存在,则取消上传 — 如果发现一个上传的匹配探针,eArray会取消整个上传过程。

上传探针文件详细信息

上传类型

选择以下选项之一:

仅上传探针 从上传文件的数据创建探针,并将其作为eArray中您可使用的独立探针。

创建新探针组 从上传文件的数据创建探针,并将所有探针置于一个探针组中。为探针组输入一个名称。

上传文件

  1. 点击浏览...

  2. 选择想要上传的文件,然后点击打开。
    文件的名称会出现在“上传文件”文本框中。

文件格式

选择简化格式完整格式。文件格式定义了上传文件中具体的可用数据类型。请参阅探针上传的文件格式和要求

文件类型

从列表中选择合适的文件类型。文件类型定义了文件中的数据项目怎样被具体指明和区分。eArray接受以制表位分隔的文本(*.tdt and *.txt)文件和MS-Excel (*.xls)文件。

  • 注意:注意:如果您使用Microsoft Excel 2007来创建文件,请将其保存为Excel 97-2003 兼容模式工作表。这样文件就被保存为所需的*.xls格式。

  1. 点击下一步。

    “定义上传文件栏目”框会出现在页面底部,包含您文件前几行数据的预览。

  2. eArray不会解析探针文件中任何已存在的栏目标题数据。如果您的探针文件的第一行是一行栏目标题,请选中我上传的文件包含“栏目标题”,这样eArray就不会将文件的标题行解读成一组探针数据。

  3. 在“定义上传文件”框中,在每个栏目下面的列表中,选择最匹配上面具体栏目数据的标签。

    探针ID
    序列都是必填栏目。如果您希望上传过程忽略一个指定的栏目,请选择忽略。每个标签您只能使用一次,但“忽略”除外,您可以使用多次。

  4. 点击上传。

    eArray将处理上传文件,并创建探针。如果您选择了“创建新探针组”,eArray同时会创建一个探针组。请确认仔细阅读本主题中关于探针组和重复探针的说明。

    一个消息会通知您您的文件已经被成功提交至上传队列,当上传过程完成后,eArray会发送个您一封邮件。

  5. 点击关闭。

    您可以在工作区主页的“未完成任务”框中监测上传过程。在eArray完成您的上传后,您可以查找您的新探针探针组,并在微阵列设计中使用它们。

    “探针上传”页面会出现,您可以建立另外一个探针文件上传。

相关链接

探针上传的文件格式和要求

为什么要创建探针组

编辑探针组