查看高密度(HD)查找的结果

在您提交一个CGH高密度或ChIP高密度探针查找,并且eArray完成查找之后,您就可以查看结果。

  1. 点击工作区标签。

  2. 设置应用类型CGHChIP。

  3. 点击探针标签。

    “探针查找”页面出现。

  4. 选择高密度(HD)探针查找。

    “高密度(HD)探针查找”页面出现。

  5. 如果您希望查看一个“高级高密度(HD)探针查找”的结果,请选择高级高密度(HD)探针查找。eArray会分别跟踪标准和高级高密度(HD)查找的结果。

    在页面底部,“查找结果”框会显示一个您所提交查找类型的高密度(HD)查找的列表,同时还有它们的状态。点击一个下划线的栏目标题来将查找列表按该栏目的内容进行排序。再点击该标题一次将列表按逆序排序。

  6. 在查找结果的操作栏中,在已完成的查找旁边,点击查看。

    一个“高密度(HD)查找结果”页面会出现,显示指定高密度(HD)查找结果的摘要。

  7. 点击页面顶端恰当的标签来查看所需的结果:

结果

信息

摘要结果

列出您进行查找时所提供的查找条件,以及查找结果的一个摘要。这些反映了查找结果的综合情况,并且不指定片段、注释、或探针。

关于这些结果的更多信息

详细结果

列出与“摘要结果”相似的信息,除了基因组区间或注释损坏的信息。

关于这些结果的更多信息

探针列表

列出您的高密度(HD)探针查找得到的每个探针。此探针列表包含eArray中关于探针的所有信息,包括探针ID、物种、和所关联的注释,同时还包含了外显子区域和表达区的探针数量。

eArray显示多达10,000个探针。如果您的探针列表包含多于10,000个探针,请将它们下载至您的计算机来查看所有探针。请参阅高密度(HD)查找结果的应用

染色体查看

用图表表示高密度(HD)查找的结果。基因组以三种细节层次显示。一个水平的蓝色条("光标“)显示在所有框中,反映右侧框中显示的区域的中心。

  • 左边框显示该物种的所有染色体,并让您可以选择一个染色体来进行更详细的检查。

  • 中间框显示您所选择的染色体的一个放大视图。染色体右边区域的标记表示查找得到的染色体的位置。

  • 右边框显示一个区域的详细视图。

若要在一个染色体的特定区域查看探针:

  1. 在左边框中,选中想要的染色体。您可以选择与查找所得的探针相关联的染色体。
    被选中的染色体会出现在中间框中,并被指定了cytoband位置。

  2. 若要在所选中的染色体中指定的位置范围内来查看,请进行以下一项或多项操作:

  3. 在中间框中,在染色体右边的区域,垂直拖动指针。
    一个蓝色有点框会将所选区域围住。

  4. 在右边框中,点击zoom_in.gif来压缩或”放大“该位置范围。

  5. 在右边框中,点击zoom_out.gif来扩展或”缩小“该位置范围。

  6. 在右边框中,点击scroll_down.gif来向下滚动染色体的查看区域。

  7. 在右边框中,点击scroll_up.gif来向上滚动染色体的查看区域。

  8. 起始停止输入位置编号,然后点击GO。

所指定的区域会出现在中间框中的蓝色有点矩形中。在右边框中,会出现一个该指定区域的更详细的视图,包括所返回的探针的名称。

  1. 在中间框和右边框中,点击探针显示区域的任何位置,来将所选区域的中心变换到另外一个染色体位置上。

对于任何探针查找方式的查找结果,您都可以下载至您的计算机、用该探针查找结果创建一个新高密度(HD)探针组,以及进行一次新的高密度(HD)探针查找。请参阅高密度(HD)探针查找结果的应用

相关链接

什么是高密度(HD)查找

怎样进行高密度(HD)查找

查看高密度(HD)查找的查找准则