怎样进行“GO查找”

“GO( Gene Ontology)查找”是一种基于您指定的GO术语来返回探针的专门的查找工具。关于GO查找的综述,请参阅什么是GO查找

  1. 点击工作区标签,或者进入一个合作

  2. 设置应用类型表达谱GO查找仅可用于表达谱类型探针。

  3. 点击探针。

    “查找”页面会出现。默认选择为“简单探针查找”。

  4. 选择GO查找。

    “GO查找”页面会出现。

  5. 指定以下查找条件。除另作说明,所有参数均为必填。

    1. 创建新探针组

    2. 下载探针

    3. 删除探针

    4. 查看探针序列、统计数据、注释、和登录号

    5. 计算承载探针所需的微阵列数量

参数

说明/详细信息

GO关键词

如要为查找找到并选择GO术语,请按以下步骤操作:

  1. 点击选择并添加。
    “GO关键词”选择页面会在一个新窗口中打开。

  2. GO术语处,输入一个完整或部分的GO术语。

  3. 物种处,选择想要的物种。

  4. 点击查找。
    一个匹配的GO术语列表会出现在“GO注释类别列表”中。

  5. 在“GO注释类别列表”中定位所想要的GO术语,然后点击其名称将其选中。如要在多个页面间翻页,请使用页面链接。如要将列表按逆序排列,请点击GO术语栏目的标题。

  6. 点击添加 >。
    eArray会将被选择的GO术语转移到“已选择GO注释”列表中。

  7. 您可以添加任意数目的GO术语。

  8. 如要添加另外一个术语,点击其名称,然后点击添加 >。

  9. 如要添加一个页面中可见的全部术语,点击添加全部 >>。

  10. 如要重新开始,点击 << 移除全部。

  11. 如要将一个指定的术语从“已选择GO注释”列表中移除,选择它的名称,然后点击 < 移除。

  1. 点击完成。
    选择窗口会关闭,并且被选择的术语会出现在“GO术语”中,以分隔符分离。被选择的术语会替代该处原有的任何内容。

文件夹

从列表中选择一个文件夹。GO查找将会仅从该被选择的文件夹中返回探针。如果您想要在您的查找中包括该文件夹的子文件夹,请选中包含子文件夹。

物种

从列表中选择想要的物种。

在以下探针组中被应用

(选填) 如要选择探针组,点击选择并添加。请参阅选择探针组进行探针查找

如果您设置此条件,GO查找将仅从被选择的探针组中返回探针。请注意,GO查找无法查找高密度(HD)探针组。

精确查找

(选填) 如果您希望GO查找返回探针所关联的GO术语精确匹配于“GO术语”文本框中的内容,请选中此选项。否则,查找返回其关联的GO术语包括查找字符串的探针。请参阅什么是“精确查找”

  1. 点击查找。

    eArray会开始您要求的查找。查找可能要花费一些时间。会有一个消息指示查找正在进行中。

    当eArray完成查找后,一个“查找结果”框会出现,包含匹配您查找条件的探针。您可以用对它们进行以下操作:

    1. 创建新探针组

    2. 下载探针

    3. 删除探针

    4. 查看探针序列、统计数据、注释、和登录号

    5. 计算承载探针所需的微阵列数量

此外,您可以自定义eArray来预先设置特定的查找参数。您也可以自定义查找结果中显示的内容和栏目顺序。请参阅设置用户偏好

相关链接

什么是GO查找

GO查找举例

查找探针