查看探针

 

本主题描述了怎样查看查找您的探针GO探针查找工具返回的探针。查找结果让您可以查看返回探针的以下信息:

查看探针序列和统计信息

查看探针的登录号

查看探针注释

本主题描述了怎样基于主eArray探针数据库中的探针查找来查看探针。您可以用其他eArray工具来查看由GE探针设计简单叠瓦式探针设计基因组叠瓦式探针设计GE探针检查、和高密度(HD)查找获得的探针。此外,您可以在查看探针组时查看探针。

查看探针序列和统计信息

您可以查看选定探针的序列和ID信息,以及基于它们碱基组成的统计结果。

  1. 进行一次主探针数据库的探针查找

    一个查找结果框会出现,包含匹配您查找条件的探针。

  2. 在“查找结果”框中,选择想要的探针。用以下作为向导:

  1. 点击显示统计结果。

    一个探针列表会出现。每个探针的ID和序列信息都会显示,以及基于探针序列的统计计算结果。下表描述了这些统计值。

统计值

描述

举例

长度

探针中的核苷酸数量

安捷伦表达谱探针A_12_P119943含有60个核苷酸,则长度 = 60。

G%

探针序列的碱基中G碱基所占的百分比

与上面相同的探针:11 Gs; %G = 18.33%

C%

探针序列的碱基中C碱基所占的百分比

与上面相同的探针:16 Cs; %C = 26.67%

A%

 

探针序列的碱基中A碱基所占的百分比

与上面相同的探针:13 As; %A = 21.67%

T%

探针序列的碱基中T碱基所占的百分比

与上面相同的探针: 20 Ts; %T = 33.33%

GC%

探针序列的碱基中C和G碱基共同占有的百分比

与上面相同的探针:11 Gs and 16 C's. % GC = 45%

PolyX

探针序列中最长的连续相同碱基(homeomeric run)数目,以碱基对为单位。

ATTAGTTTATG的PolyX为3,因为它包含一个连续的三个T。与上面相同的探针包含最长连续碱基对为5,因此PolyX为5。

FivePrimeAs

获探针5'端的任何 poly A序列的长度

与上面相同的探针:FivePrimeAs = 0

BC_Score

碱基组成评分: 一个根据探针的碱基组成和分布来定义序列捕获探针质量的数值。

BC_1为最佳,BC_Poor为最差。

 

查看探针登录号

  1. 进行一次主探针数据库的探针查找

    一个查找结果框会列出匹配您查找条件的探针。如要在多个页面间进行翻页,请使用“页面”链接。

  2. 每个探针关联的登录号都出现在“查找结果”框的“登录号”栏中。

    如果一个登录号显示为一个超链接,点击该链接就会在一个新窗口中打开相关的数据库。对于microRNA探针,miMAT# 栏(成熟miRNA的登录号)会出现在“登录号”栏中。

 

查看探针注释

当您进行一次主探针数据库的探针查找,一些探针注释信息会出现在探针查找结果的初始表格中。查找结果中注释的可用性根据应用类型而异。

如要查看更多的注释信息,从探针查找结果中进行以下任意操作。这些选项的可用性根据应用类型而异。

相关链接

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