在OpenGenomics上发布内容

 

OpenGenomics.com是一个安捷伦资助的网站,专门用于基因学相关的新闻、演示、研究、产品、和资源。此网站同时包含了一个微阵列设计和Sureselect靶向序列捕获探针文库的“仓库”,存储全世界的eArray用户设计的微阵列和序列捕获探针文库。在提交一个自定义微阵列设计或序列捕获探针文库到安捷伦后,您就可以在OpenGenomics.com上发布它了。您发布的每个设计都出现在此网站的一个单独的、可查找的发布页面上。除了设计文件之外,您还可以加入描述性的信息、一幅图片、以及额外的文件和网址链接。此项服务可用于eArray中“表达谱”、“CGH”、“ChIP”、“SureSelect捕获微阵列”和“SureSelect靶向序列捕获”应用类型。

当您第一次发布您的设计时,eArray会在OpenGenomics的界面中隐藏发布页面,这就让您可以在共享一个设计页面前先编辑公共设计页面。当您对您的页面满意了之后,您就可以使之可见,那么浏览OpenGenomics.com的用户就可以看到它了。如果您允许的话,用户也可以下载微阵列设计或序列捕获探针文库文件、查看该设计在eArray中的详细信息、和/或从安捷伦订购该设计。

本主题包含以下部分:

 

在您发布内容之前

 

从您的个人用户工作区发布内容

  1. 点击工作区标签。

    工作区主页将出现。

  2. 设置应用类型

  3. 查找浏览想要发布的微阵列设计或序列捕获探针文库。

    eArray会显示一个匹配您的查找条件的项目列表。或者,您可以点击主页标签,然后在我的设计我的序列捕获探针文库框中浏览。

  4. 在列表的操作栏中,在您想要发布的设计或序列捕获探针文库旁边,点击发布。

    一个对话框会通知您,您的“发布设计”已经被保存。

  5. 点击关闭。

    “发布区”标签下会显示一个您的发布设计页面的列表。您新发布的页面也会出现在列表中。如要将页面列表按照某个栏目的内容进行排序,请点击下划线的栏目标题。如要将列表再按逆序排列,请再次点击该栏目标题。

  6. 编辑页面

    当您编辑您的发布页面时,您可以编辑通用信息,并添加附件,包含超链接、文件、以及一幅图片。您也可以查看您的页面的预览。此外,您也可以允许OpenGenomics.com站点的访问者下载您的设计文件、从安捷伦订购该微阵列、以及复制链接,这样他们就可以直接打开发布页面。在您保存了您的编辑之后,eArray会将您返回到发布页面的列表处。

  7. 选中您新的发布页面旁边的复选框,然后点击使可见。

    对于微阵列设计的发布,一个对话框会通知您,如果您选中的发布设计是一个微阵列设计集的一部分,那么该微阵列设计集中的全部发布设计都会被设为可见。

  8. 点击关闭。

    eArray会将您的发布页面发布到OpenGenomics.com上去。所有访问者现在都可以查看您新的发布页面了。

    您可以在您的个人工作区或合作区来使用“发布区”标签。通过此标签,您可以对您的发布设计页面进行进一步的编辑隐藏它、或删除它。

  9. 注意:

    在发布了一个设计或序列捕获探针文库之后,您就不能删除该设计或将它移动到其他文件夹中。

    (SureSelect靶向序列捕获应用类型) 如果您发布一个合并序列捕获探针文库,eArray不会自动单独发布其中的补充序列捕获探针文库。然而,您可以像发布一个常规的自定义序列捕获探针文库一样发布一个补充序列捕获探针文库。

 

从合作区发布内容

您必须拥有合作领导者角色,才能从合作区发布一个设计或序列捕获探针文库。下面的步骤流程即适用于开启发布过程并选择提名人的第一位领导者,也适用于要批准对提名人的选择的其他领导者。

  1. 进入一个合作

  2. 设置应用类型

  3. 查找浏览想要发布的微阵列设计。

    eArray会显示一个微阵列设计的列表。

  4. 在列表的操作栏中,在您想要发布的设计旁边,点击发布。

    一个对话框会出现。

  5. 您和其他合作领导者必须选择该设计的提名人。提名人要建立并管理与该设计关联的发布设计页面。请参照以下步骤:

  1. 如果您是开启发布过程的第一位合作领导者,那么就请您在提名人处选择您希望的提名人。
    eArray会将选中的领导者作为该设计的提名人,并向其他领导者也发送电子邮件通知。包括您在内的全部领导者,接下来必须完成步骤b– d。如果您不是开始发布过程的第一位领导者,您就不能更改出现在“提名人”处的名字。

  2. 决定处,在您的名字旁边,选择以下选项之一:

  3. 理由处,在您自己的名字旁边,为您的决定输入一个理由。
    其他领导者可以看到您的决定以及您在此框内输入的理由。

  4. 点击完成。
    如果全部的领导者都对一位提名人候选人选择“是”,那么eArray就会创建并保存发布设计页面。仅有被选中的提名人可以编辑并管理该发布设计页面。一个对话框会通知您,该发布设计已经被保存了。

  1. 点击关闭。

    “发布区”标签下会显示一个合作区发布设计页面的列表。新发布的页面也会出现在列表中。如要将页面列表按照某个栏目的内容进行排序,请点击下划线的栏目标题。如要将列表再按逆序排列,请再次点击该栏目标题。

  2. 编辑页面

    当您编辑您的发布设计页面时,您可以编辑通用信息,并添加附件,包含超链接、文件、以及一幅图片。您也可以查看您的页面的预览。此外,您也可以允许OpenGenomics.com站点的访问者下载您微阵列的设计文件、从安捷伦订购该微阵列、以及复制链接,这样他们就可以直接打开发布设计页面。在您保存了您的编辑之后,eArray会将您返回到发布设计页面的列表处。

  3. 选中您新的发布设计页面旁边的复选框,然后点击使可见。

    一个对话框会通知您,如果您选中的发布设计是一个微阵列设计集的一部分,那么该微阵列设计集中的全部发布设计都会被设为可见。

  4. 点击确认。

    eArray会将您的发布设计页面发布到OpenGenomics.com上去。所有访问者现在都可以查看您新的发布设计页面了。

    您可以在您的个人工作区或合作区来使用“发布区”标签。通过此标签,您可以对您的发布设计页面进行进一步的编辑隐藏它、或删除它。

  5. 注意:在发布了一个设计之后,您就不能删除该设计或将它移动到其他文件夹中。