查找序列捕获探针文库

 

您可以根据很多条件来在eArray中查找序列捕获探针文库。eArray将返回一个匹配您的查找条件的序列捕获探针文库的列表,并且您可以对它们进行操作。

  1. 点击工作区并且,或者进入一个合作

  2. 设置应用类型靶向序列捕获。

  3. 点击序列捕获探针文库标签。

    “序列捕获探针文库查找页面”将出现。

  1. 随意设置以下的查找参数。您在之前步骤设定的查找设置将决定那些参数是可用的。您可以在任何时候点击重置来清空全部查找参数。

参数

说明/详细信息

序列捕获探针文库名称

输入一个序列捕获探针文库的完整或部分名称。

文件夹名称

默认情况下,eArray在您可访问的全部文件夹中查找序列捕获探针文库 (就是全部选项)。如要将您的查找限定在指定文件夹之内,请从列表中选择指定的文件夹。列表仅包含您具有访问权限的文件夹。如要在您的查找中包含子文件夹,请选中包含子文件夹。

物种

如要选择一个或多个物种,请参照以下步骤:

  1. 点击选择并添加。
    一个物种选择页面将在一个新窗口中打开。

  2. 在物种类别列表下的名称处,输入想要的物种的完整或部分名称,然后点击查找。如要返回一个全部物种的列表,请不要填写名称。
    一个查找结果框会出现,包含匹配您输入的名称的物种。如果查找结果包括多个页面,您可以使用页面链接来进行翻页。

  3. 点击所需物种的名称来将其选中。您可以在一个页面选择多个物种。

  4. 点击添加 >.
    eArray会将物种转移到“已选择物种”列表中。

    如要转移所有页面上的全部物种,请点击添加全部 >>,然后在出现的对话框中,点击确认。

    如要重新开始,请点击<< 移除全部。如要移除物种,请在“已选择物种”列表中将其选中,然后点击 < 移除。

  5. 点击完成。
    被选中的物种将出现在查找页面中的“物种”处。多个物种会以分隔符分离。

  6. 注意:当eArray根据物种来查找序列捕获探针文库时,它仅查找与之关联的主要物种。即使您在您的查找条件中指定了多个物种也如此。此外,如果您希望返回没有指定物种的序列捕获探针文库,请不要设定“物种”查找条件。

ELID

输入想要的序列捕获探针文库的ELID号。多个ELID号请用分隔符"|" 分隔。一个ELID (Enrichment Library ID)号就是用来识别一个具体的序列捕获探针文库的唯一安捷伦标识符。安捷伦在您提交一个序列捕获探针文库至生产部门时创建一个ELID。它与AMADID(Agilent microarray Design ID)相似,但ELID没有附加一位额外的数字。

如要上传一个ELID号的文件,请参照以下步骤:

  1. 请准备一个纯文本文件,包含想要的AMADID号的列表。用换行符号(回车)分隔各个条目。

  2. 点击上传。
    一个文件上传窗口将出现。

  3. 点击浏览。
    一个选择文件对话框将出现。

  4. 选择想要上传的文件,然后点击打开。

  5. 在文件上传窗口,点击上传文件。
    eArray将上传选中的文件。

设计状态

选择全部、活跃已废弃。

您可以通过查找状态为“已废弃”的序列捕获探针文库来将其更新为新的格式。

创建者

输入您想要查找的序列捕获探针文库的所有者。

创建日期

指定一个日期范围。点击在旁边的 calendar_icon.gif ,然后从出现的日历中选择您想要查找的日期。

包含序列捕获探针组

设定此参数来查找包含指定序列捕获探针组的序列捕获探针文库。如要将使用的序列捕获探针组作为查找条件,请点击查找并添加。

一个序列捕获探针组选择页面将在一个新窗口中出现。选择序列捕获探针组的过程与选择序列捕获探针组的过程相似,请参阅选择序列捕获探针组进行序列捕获探针查找

选中的序列捕获探针组将出现在查找页面中,以分隔符分隔。

关键词

请输入一个完整或部分关键词,或者多个用逗号分隔的关键词。

长度

当前,安捷伦支持长度为120个核苷酸的序列捕获探针。

  • 注意:
    一个给定序列捕获探针文库中的序列捕获探针均具有相同长度。

  1. 点击查找。

    一个查找结果框会列出匹配您的查找条件的序列捕获探针文库或序列捕获探针文库集。

    使用页面链接来在结果的多个页面间翻页。如要按任何栏目(除操作外)的内容来排序结果,请点击该栏目标题。如要按逆序排列,请再次点击该栏目标题。

    如要将您的查找结果按设计格式和/或状态来进行限定,请从查找结果上方的设计格式状态列表中,选择想要的选项,然后点击筛选器。如要恢复至全部结果,请在两个列表中都选中选择,然后再次点击筛选器。
    在eArray完成了您的查找后,您就可以使用查找结果来对返回的一个或多个序列捕获探针文库进行操作了。请参阅关于序列捕获探针文库的可执行操作

针对序列捕获探针文库的查找可以返回多种序列捕获探针文库类型。这些类型可以出现在查找结果的“序列捕获探针文库类型” 栏中:

序列捕获探针文库类型

描述

正常

一个自定义序列捕获探针文库或安捷伦目录序列捕获探针文库,不为基础库、补充库、或合并库。

基础

一个安捷伦目录序列捕获探针文库,为您创建补充序列捕获探针文库提供序列捕获探针叠瓦式设计参数。仅有特定的安捷伦目录序列捕获探针文库可以作为基础库。安捷伦目录序列捕获探针文库同时可作为单独的个体使用。

补充

一个与具体基础库相关联的补充序列捕获探针文库。eArray使用序列捕获探针叠瓦式设计来创建序列捕获探针到您指定的基因组片段上,根据基础库的参数来进行设计。请参阅创建补充序列捕获探针文库。补充序列捕获探针文库同时可作为单独的个体使用。

合并

一个包含一个基础库和一个补充库的序列捕获探针文库。请参阅创建一个合并序列捕获探针文库

  1. 注意:您可以预先设定指定的参数,并自定义查找结果的栏目内容和顺序。请参阅设置用户偏好

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