序列捕获探针

对于靶向序列捕获应用类型，序列捕获探针是一些提取指定基因组DNA片段用于测序的寡核苷酸。所需的DNA与序列捕获探针杂交，其他DNA则不与之杂交。这是一个强大的选择方法，让您可以专注于您的测序工作。安捷伦生产的序列捕获探针是生物素化的RNA寡核苷酸。目前，安捷伦制造长度为120个核苷酸的序列捕获探针。

在eArray中，单个序列捕获探针为一个与一唯一BaitID和物种关联的核苷酸序列。尽管安捷伦提供的最终产品为一个RNA寡核苷酸试剂盒，但安捷伦会首先创建DNA寡核苷酸，然后将其翻译成为RNA。因此，eArray中的序列捕获探针序列用DNA碱基表示(A, C, G, T)。序列捕获探针序列可以在有意义链 (+) 或者反意义链 ( – ) 方向上，序列捕获探针文库也可以包含任意取向的序列捕获探针。还可添加额外的注释，例如所关联的基因组片段、染色体位置、基因符号、以及登录号。您可以通过以下几种方式来使用序列捕获探针：

查找序列捕获探针 – eArray允许您查找已存在于“安捷伦目录”或您自己的eArray文件夹中的序列捕获探针。在任意一种查找类型中，除了以下列出的特性外，您还可以按物种、序列捕获探针长度、关联的序列捕获探针组、以及所在的文件夹来限定您的查找。

上传 – 您可以准备一个包含序列捕获探针的文件并将其上传到您eArray中的账户中。您也可以基于上传文件中的序列捕获探针来创建一个新的序列捕获探针组。
序列捕获探针叠瓦式设计 – 此过程创建的序列捕获探针以平均间距覆盖一个给定物种的指定的基因组区域。您可以自定义叠瓦式设计过程的测序技术和测序流程，以及调整叠瓦式设计的密度。eArray提供基因组片段查找器来帮助您定义基因组叠瓦式设计的基因组片段，它会根据您指定的注释值来返回相应的基因组片段，另外一个工具是外显子片段查找器，可以返回外显子基因组片段。

对于特定的安捷伦目录序列捕获探针文库，您可以使用序列捕获探针叠瓦式设计来添加探针到未被使用的额外基因组区域。首先您需要创建一个补充序列捕获探针文库，其中包含的序列捕获探针是用所选中的基础库中相同的参数而叠瓦式设计的。此方法需要使用通过序列捕获探针叠瓦式设计来创建补充序列捕获探针文库向导。然后您就可以创建一个合并序列捕获探针文库，其中包含先前选择的安捷伦目录序列捕获探针文库和该补充序列捕获探针文库。