通过已存在序列捕获探针组来创建序列捕获探针文库(向导) |
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如果您已拥有序列捕获探针组,并且您希望通过它们来创建一个序列捕获探针文库,就请您使用本主题中描述的方法。此向导特别的针对“靶向序列捕获”应用类型,如果您指导您想要添加进序列捕获探针文库的序列捕获探针组的名称,此方法就十分有效。如果您需要使用更精确的序列捕获探针组查找,请参阅通过序列捕获探针组查找结果来创建序列捕获探针文库
注意: 如果您想要创建一个补充序列捕获探针文库,来被包含进一个合并序列捕获探针文库,请使用创建补充序列捕获探针文库向导。您不能通从已存在序列捕获探针来创建补充序列捕获探针文库。
如要查看本帮助主题的各个部分,点击以下的链接:
点击工作区标签,或进入一个合作。
设置应用类型为靶向序列捕获。
点击主页。
在您个人或合作的工作区主页,在“序列捕获探针文库向导”框中,选择通过已存在序列捕获探针组来创建序列捕获探针文库。
点击下一步
>>。
向导的第一步,选择物种,将显示在一个新窗口中。
在向导的此步骤,您选择能够最好代表您要创建的序列捕获探针文库内容的物种。
在选择物种处,选择想要的物种。
物种为必填。
点击下一步
>>。
向导的下一步,定义序列捕获探针文库,将出现。
在此步骤,您定义序列捕获探针文库的基本特性,例如名称和位置。
设置以下序列捕获探针文库参数。除非指明,所有参数均为必填。
参数 |
说明/详细信息 |
序列捕获探针文库名称 |
为序列捕获探针文库输入一个名称。eArray使用此名称作为序列捕获探针文库的一个查找条件,也是在查找结果、列表、以及类似地方用来指代此序列捕获探针文库的方式。 |
长度 |
当前,安捷伦仅能创建长度为120个核苷酸的序列捕获探针。一个序列捕获探针文库中的全部序列捕获探针组均具有相同长度。当您选择了一个长度后,eArray会自动的选择序列捕获探针文库的容量和恰当的内置质控探针组。 |
序列捕获探针文库容量 |
(只读) 当前,eArray支持容量为55k个序列捕获探针的序列捕获探针文库。如要查看更多信息,请点击显示详细信息。 |
内置质控序列捕获探针组 |
(只读) eArray自动为序列捕获探针文库选择一个合适的内置质控序列捕获探针组。安捷伦内置质控序列捕获探针组的名称会显示为一条链接。如要查看该内置质控序列捕获探针组的详细信息,请点击该链接。 所需的安捷伦内置质控序列捕获探针组包含用于在序列捕获探针文库生产过程中进行质量控制的序列捕获探针。 |
文件夹 |
为您新的序列捕获探针文库选择一个位置。那些您拥有访问权限的文件夹将出现在列表中。 |
描述 |
(选填) 为该序列捕获探针文库输入一个简要的描述。 |
物种 |
(只读) 您在向导的步骤1设置的物种将出现在这里,仅作告知用。您不能编辑它。 |
关键词 |
(选填) 输入新的查找关键词来与该序列捕获探针文库关联,用逗号分隔。指定关键词可以帮助您稍后来查找此序列捕获探针文库。 |
附件 |
(选填) 附件就是与您的序列捕获探针文库相关的文件或链接。附件文件最大可以有32 MB。如要添加一个或多个附件,请参照以下步骤:
名称 – 为附件输入一个名称。此名称将成为您访问附件而用来点击的链接。 类型 – 从列表中选择想要添加的附件的类型。一个附件可以使一个文件或是一个URL。 位置 – 从列表中选择恰当的位置。eArray使用此选项来选择已在您的区域中定位的内容,如果该内容可用的话。 文件 – (仅当您选择附件类型为“文件”时) 点击浏览... 在出现的对话框中选择想要添加的附件,然后点击打开。 URL – (仅当您选择附件类型为“URL”时) 输入因特网资源的位置URL,包括协议说明符。例如,http://www.agilent.com。
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备注 |
(选填) 输入一段备注来包含在序列捕获探针文库中。 |
点击下一步
>>。
向导的下一步,布局序列捕获探针,将出现。
在此步骤中,您要定义您想要包含在序列捕获探针文库中的序列捕获探针组。
使用下表中的操作来为您的序列捕获探针文库选择序列捕获探针组。在您添加和配置序列捕获探针组时,页面底部的“序列捕获探针文库统计信息”框也会反映出您的操作。
任务 |
说明/详细信息 |
序列捕获探针组详细信息 |
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如要向您的序列捕获探针文库中添加一个序列捕获探针组:
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查看一个序列捕获探针组 |
在序列捕获探针组名称栏中,序列捕获探针组的名称显示为链接。点击恰当的链接来查看序列捕获探针组的详细信息。 “查看序列捕获探针组”页面将在一个新窗口中打开。关于此页面的详细信息,请参阅查看序列捕获探针组。 |
移除序列捕获探针组 |
如要从序列捕获探针文库中移除一个序列捕获探针组:
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更改序列捕获探针组的对照类型 |
在序列捕获探针组详细信息下,在恰当的序列捕获探针组旁边的对照类型栏中,选择一个选项。您选择的选项不影响序列捕获探针文库的组成。eArray会将此选项附加到序列捕获探针组以用作用户参考。 neg、pos、或是ignore – 说明此序列捕获探针组包含的对照序列捕获探针是用来监测捕获质量、或者其他对照或QC应用的。 biological – 说明此序列捕获探针组包含biological探针用来捕获想要的基因组区域。 |
更改序列捕获探针组的复本数量 |
在重复栏中,在想要的序列捕获探针组旁边,输入您想要包含在序列捕获探针文库中的该序列捕获探针组的复本数量。
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点击下一步
>>。
向导的下一步会出现。
在此步骤中,您将您的序列捕获探针文库保存为一个具体的状态。
在您希望怎样保存和创建您的序列捕获探针文库?处,选择以下选项之一:
草稿 – eArray将此序列捕获探针文库保存为“草稿”状态。仅有您可以编辑此序列捕获探针文库。
审查 – eArray将此序列捕获探针文库保存为“审查”状态。您工作组中的用户可以编辑此序列捕获探针文库并保存新的版本。
完成 – eArray将此序列捕获探针文库保存为“完成”状态。此序列捕获探针文库可被提交至“安捷伦生产部门”,且没有人可以编辑它。
提交 – eArray将此序列捕获探针文库保存为“提交”状态,并将此序列捕获探针文库提交至“安捷伦生产部门”。您可以对该序列捕获探针文库进行价格咨询。如果您选择此信息,您必须也点击序列捕获探针文库检查清单,然后阅读并选中出现的所有项目。
点击保存。
eArray将创建并保存你的序列捕获探针文库。会出现一个成功的消息。
点击关闭。
会出现另外一个成功的消息。
点击关闭。
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