下载序列捕获探针文库

 

您可以下载与序列捕获探针文库关联的任何文件。这包括指定序列捕获探针ID号、序列、以及注释的以制表符分隔的文本(.tdt)文件。您也可以下载其他附件文件,例如BED格式的跟踪文件,您可以是使用该文件来在一个基因浏览器中查看序列捕获探针的位置。eArray在序列捕获探针文库状态为“审查”时生成.tdt文件,并且仅在序列捕获探针文库的状态为“完成”或“已提交”后才生成BED文件。在您查看序列捕获探针文库时,下载命令一样可用。

在您下载之前

下载一个序列捕获探针文库

  1. 查找浏览您想要下载的序列捕获探针文库。或者,查找一个eArrayXD序列捕获探针文库

    eArray将显示一个序列捕获探针文库的列表。

  2. 在查找结果的操作栏中,在您想要的序列捕获探针文库旁边,点击下载。

    一个新的将出现,包含序列捕获探针文库的基本信息,以及一个可用于下载的文件类型的列表。以下为可用文件类型:

文件类型

内容

TDT

(可用于状态为审查、完成或已提交的序列捕获探针文库。)

(以制表位分隔的文本格式) 列出库中的全部序列捕获探针。以下栏目会出现:

  • Bait ID – 每个序列捕获探针独特的名称。

  • Sequence – 每个序列捕获探针的序列,5'端或3'端取向。

  • Replicate Count – 探针在序列捕获探针文库中复本的出现次数。eArray自动复制序列捕获探针的完整集合来尽可能填充库中的可用特征点。

  • Strand – 探针设计所在的DNA链,为 + (有意义链) 或– (反义链)。

BED

(可用于状态为完成或已提交的序列捕获探针文库。)

(浏览器扩展数据格式) 一个BED 格式文件,您可以使用其来查看库中兼容基因浏览器的探针。以下栏目会出现:

  • Chromosome – 序列捕获探针设计所在的染色体

  • Start – 给定染色体上,序列捕获探针第一个碱基对

  • End – 给定染色体上,序列捕获探针最后一个碱基对

  • Bait ID – 每个序列捕获探针独特的名称

  • Score – 一个从0到1000的数值,控制浏览器中探针的灰度值。越高数值,产生的颜色越深。

  • Strand – (当可用时) 探针设计所在的DNA链,为 + (有意义链) 或– (反义链)

 

  1. 选择您想要下载的文件。如要选择全部类别,请选中栏目标题行的复选框。

    如果“文件类型”栏目中的一个条目显示为一个超链接,如要显示它的使用描述说明,请将鼠标指针置于“文件类型”栏中相应的条目上。

  2. 点击下载。

    一个对话框会询问您是否想要订阅序列捕获探针文库更新通知。

  3. 点击确认来订阅,或者点击取消来拒绝。如果您拒绝,您也可以稍后订阅

    一个“文件下载”对话框将出现。

  4. 点击保存。

    一个“另存为”对话框将出现。

  5. 为下载文件选择一个位置,然后点击保存。

    eArray将以.zip格式下载该序列捕获探针文库文件到您指定的位置。

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怎样下载文件

移动序列捕获探针文库

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