创建序列捕获探针组

 

序列捕获探针组是序列捕获探针根据逻辑准则组成的集合。您将序列捕获探针组织成序列捕获探针组,就可以将序列捕获探针组应用为创建序列捕获探针库的积木。请参阅序列捕获探针组。eArray 允许您通过若干种方式创建序列捕获探针组:

通过已存在序列捕获探针来创建序列捕获探针组

通过上传来创建序列捕获探针组

通过序列捕获探针叠瓦式设计来创建序列捕获探针组

通过一个已存在的序列捕获探针组来参加一个序列捕获探针组

 

通过已存在的序列捕获探针来创建序列捕获探针组

您可以通过安捷伦目录序列捕获探针和其他您具有访问权限的探针来创建一个探针组。

  1. 查找想要的序列捕获探针。

    查找结果会出现。

  2. 从操作结果中选择想要的序列捕获探针。

  3. 如要选中单个探针,请选中它名称旁边的复选框。

  4. 如要选择查找结果一个页面上的全部序列捕获探针,请选中查找结果栏目标题行的复选框。

  5. 如要选择当前页面的全部序列捕获探针,请选中“查找结果”栏目标题行的复选框。

  6. 如要在结果的多个页面间进行翻页,请使用页面链接。eArray会在翻页时记住您的选择。

  7. 如要将列表按逆序排列,请点击序列捕获探针ID号栏目标题。

  8. 如要选择所有页面上的全部序列捕获探针,请选择选择全部结果。
     

  1. 点击创建序列捕获探针组。

    “创建序列捕获探针组”页面会出现。在页面底部列出了选中的序列捕获探针。如果有很多序列捕获探针,eArray会自动分页。如要在多个页面间翻页,请使用页面链接。列表是按“序列捕获探针ID号”进行排列的。如要将列表按逆序排列,请点击序列捕获探针ID号栏目标题。

  2. 设置以下的序列捕获探针组参数。如不做特殊说明,所有参数都是必填的。下表中未出现的参数是系统设置的,并且为只读。

参数

说明/详细

序列捕获探针组名称

为序列捕获探针组输入一个名称。eArray使用该名称作为该序列捕获探针组在查找结果、探针组列表、查看页面等处的参考。

状态

选择未完成被锁定。默认情况下,eArray会将您新创建的序列捕获探针组状态设为“未完成”。如果您将状态设置为被锁定,您将无法编辑该序列捕获探针组。

描述

(选填) 输入一个简短的描述。

关键词

(选填) 输入一个关键词,或多个关键词,通过分隔符"|"、或逗号、或分号来分隔。eArray使用这些关键词来进行查找和浏览功能。

文件夹

选择一个文件夹。eArray会将新的序列捕获探针组保存在此位置。列表中仅会出现您对其拥有访问权限的文件夹。

  1. 如需要,请按以下描述添加或移除序列捕获探针。

  2. 点击保存序列捕获探针组。

    eArray会创建并保持该序列捕获探针组,并显示一个消息。

    如果该序列捕获探针组很大,eArray会通过一个后台任务来创建该序列捕获探针组。您将在任务完成后收到一封电子邮件。您也可以在工作区或合作区的主页上,在“等待中任务”框中监测任务的状态。

  3. 点击关闭。

 

通过上传来创建序列捕获探针组

您可以通过上传探针来将新内容引入eArray中。作为上传过程的一部分,您可以创建包含所上传探针的新探针组。

当您的上传完成后,eArray会创建您所要求的序列捕获探针组。然后您可以查找该序列捕获探针组编辑它,并使用它来创建一个序列捕获探针文库。

 

通过序列捕获探针叠瓦式设计来创建序列捕获探针组

“序列捕获探针叠瓦式设计”创建以平均的间距覆盖到指定的基因组区域上的序列捕获探针。请参阅序列捕获探针叠瓦式设计。然后您可以应用“序列捕获探针叠瓦式设计”生成的序列捕获探针来创建一个新序列捕获探针组。新的序列捕获探针组的名称会和该“序列捕获探针叠瓦式设计”任务的名称相同。

在您应用“序列捕获探针叠瓦式设计”的结果创建一个新序列捕获探针组之前,您首先必须建立一个序列捕获探针叠瓦式设计任务,并将它提交至安捷伦进行处理。当您的任务完成后,它会出现在“序列捕获叠瓦式设计”页面的“查找结果”框中,状态为“已完成”。eArray允许您应用以下流程一次为一个“序列捕获叠瓦式”设计的集合来创建序列捕获探针组。如果您需要此序列捕获探针组的多个复本或版本,请使用复制序列捕获探针组命令。

  1. 点击工作区标签。

  2. 设置应用类型靶向序列捕获。

  3. 点击序列捕获探针 > 序列捕获探针叠瓦式设计。

    “序列捕获探针叠瓦式设计”页面会出现。一个查找结果框会出现在页面底部,列出您当前的“序列捕获探针叠瓦式设计”任务。

  4. 在“查找结果”框的操作栏中,在想要的已完成任务旁边,点击创建序列捕获探针组。

    一个消息会通知您,您将在序列捕获探针组创建任务完成后收到一封电子邮件。在您收到电子邮件之后,您然后就可以查找浏览新的序列捕获探针组了,并将其应用到一个序列捕获探针文库中去。新的序列捕获探针组的名称将会相应的“序列捕获探针叠瓦式设计”任务名称相同。

  5. 点击退出。

 

通过一个已存在的序列捕获探针组来创建序列捕获探针组

若想通过一个已存在的序列捕获探针组创建一个新序列捕获探针组,您需要搜索该已存在的序列捕获探针组,并将其复制。接下来您编辑该复本。当已存在的序列捕获探针组包含大多数或者全部您在新序列捕获探针组中需要用到的序列捕获探针时,这个方法就很有效。

  1. 查找浏览想要使用的已存在序列捕获探针组。

    一个查找结果框会列出匹配您的查找条件的序列捕获探针组。使用页面链接来在多个页面间跳转。

  2. 在“查找结果”框的操作栏中,在想要的序列捕获探针组旁边,点击复制。

    在eArray创建了您的序列捕获探针组后,一个成功的消息会出现。

  3. 点击关闭。

    “编辑序列捕获探针组”页面会出现。

  4. 按需要编辑序列捕获探针组。请确保选择了您想要的路径文件夹。

    如果您想要移动共享该序列捕获探针组,但它已经被使用在一个序列捕获探针文库中了,您可以制作一个该探针组的精确复本,然后移动或共享该复本。请创建复本并不要对其进行任何编辑。

  5. 点击保存序列捕获探针组。

    eArray会创建并保持该序列捕获探针组,并显示一个消息。

    如果该序列捕获探针组很大,eArray会通过一个后台任务来创建该序列捕获探针组。您将在任务完成后收到一封电子邮件。您也可以在工作区或合作区的主页上,在“等待中任务”框中监测任务的状态。

  6. 点击关闭。

相关链接

序列捕获探针

靶向序列捕获和eArray

序列捕获探针文库