学习使用eArray

标签

描述

工作区

此标签下，您可以作为个人用户创建并管理微阵列。您还可以在此访问您的个人信息、密码、和用户偏好设置。如果您是一位工作组管理员，您还可以在此标签下通过“我的功能”标签使用用户管理功能。

合作区

此标签下，您可以在与它人的合作中创建和管理微阵列。您还可以访指定的合作空间，并且可以创建、加入以及管理合作空间。

发布区

此标签下，您可以在OpenGenomics.com上发布您的定制微阵列设计，该站点是安捷伦的一个丰富的资源，其中包括共享设计、研究、新闻和其他有关微阵列的信息。

标签

主要可用功能

首页

• “搜索”栏—通过本栏您可以使用eArray的很多搜索查找功能，这些功能也包含在其他特定的标签下，但您无需转向那些标签就可以完成搜索。

• “挂起任务”栏—有很多eArray任务是计算任务或数据密设计集型任务，需要等待eArray来完成。通过本栏，您可以监测您已提交到eArray的任务状态，并对其进行操作。点击查看全部来查看完整列表，点击刷新来更新列表至最新版本。

• “设计向导”栏—本栏是向导的起点，该向导会带领您至一种特定的微阵列创建方法。请参阅通过向导来创建一个微阵列设计/设计集。点击查看全部来查看进行中的向导的完整列表，点击刷新来更新列表至最新版本。

• “我的设计”栏—本栏显示了您已完成并提交至安捷伦生产部门的微阵列设计和微阵列设计集。您可以下载这些设计并对它们进行价格咨询。如果您之前从安捷伦购买过任何产品，您也可以通过eArray从安捷伦在线商店购买微阵列。击查看全部来查看完整列表，点击刷新来更新列表至最新版本。

微阵列

• 查找 – 产生一张符合您查找条件的微阵列设计或微阵列设计集的列表。通过这张列表，您可以进行很多在eArray中对微阵列设计和微阵列设计集的可行操作。

• 创建微阵列—根据您的应用类型让您访问微阵列设计创建向导。

• 浏览ArrayDesign—产生一张微阵列设计列表，这些设计是基于您所选择的特定文件夹或类别。通过这张列表，您可以进行很多在eArray中对微阵列设计和微阵列设计集的可行操作。

• 浏览ArraySet—产生一张微阵列设计集列表，这些设计集是基于您所选择的特定文件夹或类别。通过这张列表，您可以进行很多在eArray中对微阵列设计和微阵列设计集的可行操作。

• Express Array—允许您上传探针文件并将其直接提交至安捷伦生产部门。此功能可用于CGH、ChIP以及表达谱应用类型。

• 通知—显示您已订阅设计更新通知的微阵列列表。您也可以取消或恢复您的订阅。

• Array计算器—在一个新窗口中打开Array计算器。让您可以计算一个特定设计所需的微阵列载片数量，以及其他相关的array数据。

• 价格咨询—让您可以对一个特定微阵列设计或微阵列设计集提出价格咨询。如果您之前从安捷伦购买过任何产品，通过此链接您也可以从安捷伦在线商店购买微阵列。

探针组

• 查找—产生一张符合您查找条件的探针组列表。通过这张列表，您可以进行很多在eArray中对探针组的可行操作。

• 浏览探针组—产生一张探针组列表，这些探针组是基于您所选择的特定文件夹或类别。通过这张列表，您可以进行很多在eArray中对探针组的可行操作。

探针

• 查找—提供给您多种在eArray的探针数据库中查找的不同方法。

• 上传—将探针从您的计算机上传至eArray。此功能可用于除microRNA应用类型外的其他全部应用类型。

• 简单叠瓦式设计 – 创建以平均间隔均匀覆盖所上传序列的表达谱类型探针。

• 基因组叠瓦式设计 – 创建覆盖eArray中可用安捷伦基因组序列数据的指定区域的CGH、ChIP、或SureSelect Capture微阵列类型探针。

• GE探针设计—从所上传的目标序列数据中创建表达型探针。

• GE探针检查—分析表达型探针，来确定其是否能在安捷伦平台上工作，并执行安捷伦协议。此外，分析探针来决定潜在目标和交叉杂交问题。

• 重新添加注释—接受探针组或一个上传的探针文件。产生一个可下载文件，包含探针和从公用数据库最近更新的注释。此功能可用于表达谱、CGH以及ChIP应用类型。

• DNA Analytics下载—让您可以下载用于安捷伦DNA Analytics程序的补充文件。

• GeneSpring下载– 让您可以下载可用于“安捷伦GeneSpring ”程序的文件，此功能可用于Expression应用类型。

• 探针评分 – 在CGH和ChIP类型探针组中计算非安捷伦探针的表现评分。评分越高，探针应用于安捷伦平台下的CGH或ChIP微阵列时具有良好对数比率曲线的可能性就越大。

我的功能

本标签仅对工作组管理员可用。

• 用户—查找用户，编辑用户信息，访问权限以及密码。创建、启用、禁用和删除用户。

• 浏览结构—为eArray探针组和微阵列设计/设计集的浏览功能设置类别和子类别。

我的账户

• 个人信息—修改您自己的联系信息和密码。

• 管理文件夹—添加、删除或重命名子文件夹。

• 用户偏好—自定义默认的查找参数和查找结果页面的栏目内容。您也可以创建定制探针筛选器并管理它们。

站点维护

本标签仅对工作组管理员可用。

• 活跃会话—查看您工作组中正登陆到eArray用户列表。

框

描述

进行中的合作

列出您当前的合作。您可以使用此框来对一个具体的合作进行查找。您可以：进入 (查看)它的工作区、邀请他人来加入它，从其中将您自己移除，以及如果您是一名领导者，您可以解散它。您也可以创建一个新合作。

查找合作

根据名称、描述、关键词、或状态来找到一个已存在的合作。更多信息，请参阅查找合作。

我收到的邀请

列出您被邀请参加的合作。您可以从此框中接受或拒绝这些邀请。

我发出的邀请

列出您发送给他人参加此当前合作的邀请。如果您是一名领导者，您也可以重新发送或撤消邀请。

命令

描述

邀请用户

发送e-mail邀请给可能的合作者。

管理邀请

(仅合作领导者) 查找和操作合作的邀请。

管理用户

(仅合作领导者) 为合作者分配角色或从合作中移除用户。

管理文件夹

在合作中添加、删除、或重命名文件夹。

退出合作

退出合作工作区并返回至合作首页。

用户偏好

为合作进行用户偏好设置。